Aspera——数据下载界的“火箭”,用SRR号批量高效获取FASTQ或SRA数据 Aspera是一款高效的生物信息学数据下载工具,可利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据,显著提升科研效率。本文通过个人视角分享了Aspera的使用方法及其优势。 简书热点 2025年02月14日 19:35 0 点赞 0 评论 61 浏览
用maftools包分析突变数据,绘制瀑布图:小白也能轻松上手 本文详细介绍了如何使用maftools包分析突变数据,并绘制出精美的瀑布图。从安装到实际操作,每一步都配有详细的代码示例,让即使是初学者也能轻松掌握。 简书热点 2025年03月01日 00:27 0 点赞 0 评论 49 浏览
GTF处理脚本 - GTFtools:数据科学家的福音 作为一名数据科学家,他在简书平台上发现了GTFtools这一强大工具。通过实际应用,他深刻体会到GTFtools在处理GTF格式文件时的高效与便捷,为基因组学研究带来了新的可能性。 简书热点 2025年04月16日 10:32 0 点赞 0 评论 47 浏览
ChIPseeker绘图函数借用:从初学者到进阶者的蜕变 本文从个人视角出发,详细介绍了ChIPseeker绘图函数的使用方法和技巧,分享了从初学者到进阶者的成长历程,并展望了ChIPseeker在未来的发展前景。 简书热点 2024年11月30日 06:32 0 点赞 0 评论 80 浏览
单细胞WGCNA分析:揭开恶性肿瘤预测的新篇章 本文以一位年轻科研工作者的视角,详细介绍了hdWGCNA这一单细胞WGCNA分析方法的核心原理及其在恶性肿瘤研究中的应用,尤其是如何通过PRS识别低存活率的STAD患者。文章结合真实案例,深入探讨了该技术的挑战与未来前景。 简书热点 2025年03月20日 12:37 0 点赞 0 评论 52 浏览
转录组分析(三):GO与KEGG富集分析及可视化实战 本文详细介绍了转录组分析中GO与KEGG富集分析的具体步骤及其实现方法,并结合条形图和气泡图展示了差异基因的功能解读,帮助读者快速掌握相关技能。 简书热点 2025年02月11日 13:07 0 点赞 0 评论 62 浏览
用R包Seurat封装函数,轻松搞定单细胞数据分析 本文详细介绍了如何使用R包Seurat封装函数,简化单细胞数据分析流程。文章以个人视角出发,分享了封装函数的实际应用案例以及带来的效率提升。 简书热点 2025年02月22日 21:56 0 点赞 0 评论 57 浏览
跟着Nature Genetics学作图:R语言ggpairs散点图一次性展示多个主成分 本文详细介绍了如何使用R语言中的ggpairs包绘制PCA散点图,展示了多个主成分之间的关系,并分享了作者的学习心得和实用技巧。 简书热点 2024年12月04日 17:22 0 点赞 0 评论 71 浏览
GEO数据挖掘的实战之旅:从零开始掌握基本流程与代码 本文详细介绍了GEO数据挖掘的基本流程,包括数据获取、预处理、特征提取、模型构建以及结果可视化等内容,同时结合实际案例展示了相关代码实现。 简书热点 2025年03月03日 14:41 0 点赞 0 评论 65 浏览
SRA文件处理速度大比拼:fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump谁更胜一筹? 本文详细比较了fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump在处理SRA文件时的速度表现,通过实验数据帮助读者选择合适的工具。 简书热点 2025年02月15日 23:50 0 点赞 0 评论 59 浏览