单细胞WGCNA分析:揭开恶性肿瘤预测的新篇章 本文以一位年轻科研工作者的视角,详细介绍了hdWGCNA这一单细胞WGCNA分析方法的核心原理及其在恶性肿瘤研究中的应用,尤其是如何通过PRS识别低存活率的STAD患者。文章结合真实案例,深入探讨了该技术的挑战与未来前景。 简书热点 2025年03月20日 12:37 0 点赞 0 评论 8 浏览
转录组分析(三):GO与KEGG富集分析及可视化实战 本文详细介绍了转录组分析中GO与KEGG富集分析的具体步骤及其实现方法,并结合条形图和气泡图展示了差异基因的功能解读,帮助读者快速掌握相关技能。 简书热点 2025年02月11日 13:07 0 点赞 0 评论 19 浏览
用R包Seurat封装函数,轻松搞定单细胞数据分析 本文详细介绍了如何使用R包Seurat封装函数,简化单细胞数据分析流程。文章以个人视角出发,分享了封装函数的实际应用案例以及带来的效率提升。 简书热点 2025年02月22日 21:56 0 点赞 0 评论 14 浏览
GEO数据挖掘的实战之旅:从零开始掌握基本流程与代码 本文详细介绍了GEO数据挖掘的基本流程,包括数据获取、预处理、特征提取、模型构建以及结果可视化等内容,同时结合实际案例展示了相关代码实现。 简书热点 2025年03月03日 14:41 0 点赞 0 评论 21 浏览
跟着Nature Genetics学作图:R语言ggpairs散点图一次性展示多个主成分 本文详细介绍了如何使用R语言中的ggpairs包绘制PCA散点图,展示了多个主成分之间的关系,并分享了作者的学习心得和实用技巧。 简书热点 2024年12月04日 17:22 0 点赞 0 评论 27 浏览
SRA文件处理速度大比拼:fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump谁更胜一筹? 本文详细比较了fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump在处理SRA文件时的速度表现,通过实验数据帮助读者选择合适的工具。 简书热点 2025年02月15日 23:50 0 点赞 0 评论 16 浏览
生信领域新突破:揭秘肿瘤干细胞与免疫细胞的交互奥秘 本文详细介绍了小李团队利用单细胞测序和空间转录组技术研究肿瘤干细胞与免疫细胞、基质细胞相互作用的最新成果,探讨其对未来癌症治疗的意义。 简书热点 2025年03月01日 01:35 0 点赞 0 评论 14 浏览
跟着Nature Communications学数据分析:R语言利用宏基因组的相对丰度数据做主坐标分析(PcoA) 本文介绍了如何使用R语言进行宏基因组相对丰度数据的主坐标分析(PcoA),并通过实际案例展示了其在生物学研究中的应用。 简书热点 2024年12月01日 12:56 0 点赞 0 评论 30 浏览
Xena助力科研:TCGA数据下载的高效神器 介绍Xena作为TCGA数据下载的高效工具,分享个人使用体验以及其在生物信息学研究中的重要性。 简书热点 2025年02月12日 02:06 0 点赞 0 评论 19 浏览
小白也能轻松掌握:如何下载基因组注释文件和复制链接(以GCA_000817325.1为例) 本文以第三者的视角详细讲述了如何下载基因组注释文件的过程,特别是以GCA_000817325.1为例,从选择数据库到具体操作步骤,再到可能遇到的问题及解决方案,都进行了深入浅出的讲解。 简书热点 2025年03月22日 04:12 0 点赞 0 评论 38 浏览